厚生労働省医薬食品局がまとめた2013年度医薬関係予算概算要求では、要求額は158億1900万円で、12年度予算額に比べ66億2000万円、72・０％の増額となった。大幅増の要因は、政府の日本再生戦略実現に向けて特別重点枠で要求した67億円、東日本大震災復興特別会計の９億8000万円などを含むため。
医薬関係の予算概算要求は、▽医療イノベーション５カ年戦略の着実な実施（特別重点要求）▽地域医療の強化のための緊急対策（特別重点要求I）▽医薬品・医療機器再生医療製品の安全対策の推進▽医薬品・医療機器再生医療製品の承認審査の迅速化▽違法ドラッグを含む薬物乱用対策の推進▽血液製剤対策の推進▽後発医薬品の品質確保の充実▽今後の災害への備え（東日本大震災復興特別会計）――の八つが柱。
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