経済産業省は、２００８年度の「外資系企業動向調査」概況を公表した。全産業としては、アジア系企業の割合が４年連続して拡大しているのが特徴だが、医薬品企業では米国、欧州の企業が圧倒的に多い。常時従事者数は輸送機械企業を中心に大幅に減少、医薬品企業でも減少していた。また、医薬品企業の研究開発費は、他の産業よりも売上高に占める割合が高く、平均額は２倍となっている。
09年３月末の集計企業数は、前年より６％減少し２７６２社。製造業も前年より20％減少し５２５社、非製造業も２％減の２２３８社となっている。全産業に占める割合は、製造業が19・０％、非製造業が81・０％。
業種別に見ると、卸売業が最多で１２０６社、全産業の43・６％を占めた。次いでサービス業の３７６社、情報通信が３０６社の順になっている。母国籍別に見ると、欧州系企業が１１７５社（シェア42・５％、前年度に比べ０・９％増）、米国系企業が８４９社（30・７％、１・３％減）、アジア系企業５８１社（21・０％、０・２％増）となっている。
このうち医薬品企業は、前年より９社減り34社。欧州系企業が18社（うち英国２社、フランス３社、ドイツ３社、スイス２社、オランダ５社）、北米企業が13社（米国企業12社）、アジア系企業が３社となっている。その資本金規模は、10～１００億円が最も多く11社、次いで５０００万円以下が８社、１００億円超が５社、１億～３億円と３億～10億円がぞれぞれ４社、５０００万～１億円が２社だった。
常時従業者数は43万８０００人で、前年度に比べ26％減少した。製造業は19万５０００人で16％減、非製造業が24万３０００人で32％減となった。業種別では、製造業の輸送機械が６万３０００人で28％減、化学が１万２０００人で24％減、非製造業の卸売業は６万３０００人で９％減となってる。
医薬品企業の常時従業者は、前年度より５０００人少ない32社３万５０００人となった。米国系企業は10社８７００人、欧州企業が18社２万６０００人となっている。
売上高は、前年度より５％減の37兆４０００万円。製造業が20兆５０００万円（前年度より９％減）、非製造業は16 兆９０００万円（１％減少）。業種別にみると、製造業では輸送機械が４兆８０００万円（45％減）、化学が１兆３０００万円（34％減）。非製造業では情報通信業、サービス業などで減少している。輸出高は、５兆５０００万円（25％減少）となった。
医薬品企業の売上高は、前年度より３０００億円程度減少し、31社で２兆４０００億円。うち、輸出高は13社１０００億円だった。米国企業10社の売上高は５８００万円で輸出高は５社５７０万円、欧州企業17社では１兆８１００万円を売り上げ、うち輸出大は８社で４２７億円となっている。
経常利益は１兆１０００億円（前年度より54％減）。製造業が５８４８億円（63％減）、非製造業は５１５１億円（37％減）。業種別では、製造業の生産用機械が赤字に転じた。非製造業では、小売業が前年度より26％減少した。
医薬品企業の経常利益は、前年度より１２００億円程度減少し、29社で２５９０億円となった。米国企業が10社４７７億円、欧州企業が16社２０９０億円、アジア企業が３社17億円となっている。
設備投資額は１兆０１３８億円（前年度より35％減）。製造業は７５７８億円（39％減）、非製造業は２５６０億円（23％減）。業種別では、輸送機械が前年度より69％減、情報通信機械が29％減少となった。研究開発費は、製造業が１社平均30億１０００万円で、前年度より７％減少した。
医薬品企業の投資設備額は21社３５２億円で、米国企業は６社38億円、欧州企業が12社３０２億円、アジア企業が３社10億円だった。研究開発費は、19社で１１６５億円（１社平均61億円、売上高研究開発費比率６％）。米国企業が５社１１８億円（27億円、３・４％）、欧州企業が11社１０３７億円（94億円、７％）、アジア企業が３社９億円（３億円、６％）となっている。
