薬学部６年制第１期生を輩出した67大学の卒業者のうち約40％が薬局、約30％が病院・診療所の薬剤部（科）、一般販売業へも従来より若干多い６％強が就職し、全体として４分の３が“現場薬剤師”への道を選んだ。また、旧４年制時代に３割近くを占めた進学は、６年制になり２％にとどまった。薬学教育協議会がまとめた「2012年３月薬系大学卒業生・大学院修了者就職動向調査の集計報告」で明らかになった。
同調査は全薬系74大学のうち、今年３月に６年制第１期生を輩出した67大学全てから回答があった。６年制および４年制の卒業生ならびに大学院博士課程前期課程（修士課程）・博士後期課程（博士課程）修了者が対象。なお、同調査では８大学（国立５校、私立３校）から「６年制卒業者の進学者」に関する回答がなかった。
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