経済産業省は、２００６年の貿易動向をまとめた。医薬品貿易（円ベース）の状況を見ると、輸入は９９１２億３４００万円と前年より10％近く増加したのに対し、輸出は３７２１億１５００万円と１％強の伸びにとどまり、６１９１億円余と大幅な入超となった。
前年に比べると、輸出では血清・ワクチン等が欧州を中心に輸出額が増え、20％以上の増加を示したが、全体的には伸びは低調だった。輸入では、ホルモンが中東や東ヨーロッパで２倍以上の輸入額となり、20％以上増加したほか、血清・ワクチン等や抗生物質製剤が10％以上の高い伸び率を示した。
輸出入の状況は次の通り。
■血清・ワクチン‐欧州中心に増加
◇輸出
医薬品の種類別に見ると、輸出高が最も高いのは抗生物質で６１６億２９００万円（前年比2.8％増）、次いで医療用品（絆創膏、プラスター等）で２８８億２１００万円（15.0％増）、血清・ワクチン等２０８億７６００万円（20.2％増）だった。以下、抗生物質製剤１５４億５３００万円（2.0％減）、ビタミン類１３４億５３００万円（4.3％増）と続き、植物アルカロイド類は半減の57億５９００万円となった。最も増加率が高かった血清・ワクチン等は、欧州全域で輸出額を伸ばしている。
地域別の輸出状況では、北アメリカが１４２２億８９００万円で3.3％、西ヨーロッパが１３５０億３６００万円で0.5％それぞれ減少したが、それでも２地域で輸出総額の４分の３を占めている。これにアジアの７０４億２９００万円（12.2％増）を加えると、全体の９割を超える。
国別に見ると、[1]米国１４１５億８５００万円（3.3％減）[2]韓国２３３億０２００万円（23.5％増）[3]イタリア２２６億０４００万円（36.5％増）[4]フランス１９８億５５００万円（3.0％増）[5]オランダ１９６億５８００万円（10.9％増）――で、これら５カ国で輸出額全体の60％に達している。
また国別の伸び率を見ると、アルゼンチンが９倍近い輸出額となったほか、トルコが前年に引き続き48.0％、パナマが89.7％、インドネシアが49.5％と高い伸び率を示したほか、パキスタン、フィリピン、香港、メキシコ、ベトナムなどへの輸出が好調で、中南米やＡＳＥＡＮ地域の伸びが目立っている。
◇輸入
種類別で額が最も大きかったのは、血清・ワクチン等で１３８０億６０００万円（18.5％増）、次がホルモン製剤の１２６３億７６００万円（3.3％増）で、前年と逆転した。以下、抗生物質７１０億３３００万円（7.2％増）、医療用品６４３億４０００万円（9.7％増）、抗生物質製剤３３７億６７００万円（15.8％増）、ビタミン類１４７億８６００万円（5.9％減）と続く。最も大きな伸びを示したのはホルモンで、20.7％増の１１４億４４００万円。
輸入額を地域別に見ると、[1]西ヨーロッパ６８９７億１６００万円（9.1％増）[2]北アメリカ１７２９億３６００万円（7.9％増）――で、これら２地域で輸入全体の９割近くを占める。アジアの６３７億６１００万円（20.9％増）を加えると、総額の93％に達する。ＣＩＳ・中欧・東欧やアフリカ両地域では、額は少ないが高い伸び率を示している。
国別では、米国が最も多く１６８１億８１００万円（9.0％増）、次いでドイツ１３５９億０２００万円（9.9％増）、英国１３２２億２５００万円（0.8％増）、スイス１０９６億６０００万円（33.3％増）、フランス６９３億３０００万円（1.8％減）の順となっている。
